La guerre galactique est déclarée ! Les séparatistes, menés par le Comte Dooku, affrontent la République, soutenue par les Jedi.

Au cour d'une opération de routine contre les Séparatistes, la 313e Légion a subitement disparu. Un escadron de clones est alors formé pour la retrouver. Feras-tu partie de cette mission spéciale ?